Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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