Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP2Q16527 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP2Q16527 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms