Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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