Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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