Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms