Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms