Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPVD1Q14C86 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms