Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPRHQ149N8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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