Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms