Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 974.1 ms