Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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