Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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