Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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CDH18Q13634 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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