Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms