Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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