Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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