Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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