Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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