Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NFX1Q12986 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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