Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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