Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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