Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms