Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms