Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms