Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms