Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms