Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms