Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms