Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCL8P80075 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms