Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-24P63145 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms