Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP107P57740 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP107P57740 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms