Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIRAP54198 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms