Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOSBP53539 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOSBP53539 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOSBP53539 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOSBP53539 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms