Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB28P51157 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB28P51157 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms