Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms