Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTBP49356 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms