Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms