Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms