Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFNP31947 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFNP31947 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms