Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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