Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms