Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms