Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms