Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XPAP23025 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XPAP23025 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XPAP23025 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XPAP23025 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XPAP23025 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XPAP23025 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms