Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHCGRP22888 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms