Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PVALBP20472 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PVALBP20472 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms