Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms