Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC2P18074 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms