Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms