Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL6A2P12110 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms